Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM200CA6NKL6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms