Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms