Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC10BA6NIK2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC10BA6NIK2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC10BA6NIK2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms