Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NDN8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NDN8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NDN8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NDN8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NDN8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A6NDN8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A6NDN8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A6NDN8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A6NDN8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A6NDN8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A6NDN8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A6NDN8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A6NDN8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A6NDN8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
A6NDN8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A6NDN8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A6NDN8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A6NDN8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A6NDN8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A6NDN8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A6NDN8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A6NDN8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A6NDN8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
A6NDN8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A6NDN8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A6NDN8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
A6NDN8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A6NDN8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A6NDN8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
A6NDN8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
A6NDN8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
A6NDN8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NDN8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NDN8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NDN8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NDN8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NDN8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NDN8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NDN8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NDN8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NDN8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NDN8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A6NDN8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NDN8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NDN8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NDN8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NDN8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NDN8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NDN8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NDN8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A6NDN8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A6NDN8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A6NDN8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A6NDN8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A6NDN8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A6NDN8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A6NDN8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A6NDN8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A6NDN8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A6NDN8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A6NDN8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A6NDN8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A6NDN8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A6NDN8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A6NDN8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A6NDN8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A6NDN8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A6NDN8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A6NDN8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A6NDN8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A6NDN8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A6NDN8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A6NDN8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A6NDN8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
A6NDN8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A6NDN8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A6NDN8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A6NDN8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
A6NDN8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A6NDN8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A6NDN8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A6NDN8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A6NDN8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
A6NDN8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A6NDN8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
A6NDN8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A6NDN8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A6NDN8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NDN8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NDN8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NDN8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NDN8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NDN8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NDN8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NDN8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NDN8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NDN8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NDN8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A6NDN8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms