Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PRAMEF22A3QJZ6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PRAMEF22A3QJZ6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms