Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms