Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms