Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9Y3F1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms