Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms