Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAB39Q9Y376 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms