Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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USP18Q9UMW8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP18Q9UMW8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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