Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TUBE1Q9UJT0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms