Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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COPS7AQ9UBW8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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COPS7AQ9UBW8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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COPS7AQ9UBW8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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COPS7AQ9UBW8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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COPS7AQ9UBW8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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COPS7AQ9UBW8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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