Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms