Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms