Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms