Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP29Q9HBJ7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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