Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms