Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms