Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP1Q9C000 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms