Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms