Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SETD2Q9BYW2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SETD2Q9BYW2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SETD2Q9BYW2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SETD2Q9BYW2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
SETD2Q9BYW2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SETD2Q9BYW2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SETD2Q9BYW2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SETD2Q9BYW2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SETD2Q9BYW2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms