Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms