Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms