Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms