Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHP1Q99653 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms