Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

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Length 2,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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