Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms