Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT140Q96RY7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms