Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2orf48Q96LS8 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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