Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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USP47Q96K76 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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USP47Q96K76 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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USP47Q96K76 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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USP47Q96K76 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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USP47Q96K76 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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USP47Q96K76 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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USP47Q96K76 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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USP47Q96K76 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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USP47Q96K76 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP47Q96K76 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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