Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms