Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CLDN23Q96B33 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CLDN23Q96B33 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CLDN23Q96B33 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN23Q96B33 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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