Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-CQ95604 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms