Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRNP3Q8WYN3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms