Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HJURPQ8NCD3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms