Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms