Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms