Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms