Protein–RNA interactions for Protein: Q4V348

ZNF658B, Zinc finger protein 658B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF658BQ4V348 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF658BQ4V348 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms