Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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