Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms