Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP7Q16576 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms