Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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