Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNIP1Q15025 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms