Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GAPVD1Q14C86 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
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