Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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