Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3AQ14563 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms