Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC3Q14003 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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