Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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DDX39BQ13838 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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