Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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